古代ヒトDNAの浄化

新しい技術は、このペルーのミイラのような古代の人間からDNAを解読することを安くすることができます。

ボストン - Ötziのゲノムでは、 5300歳のiceman 、さらには ネアンデルタール人 最近DNAシーケンシングラボから出てきて、古代の人間の遺伝子コード全体を集めるのは今やケーキだと思うかもしれません。しかし、これらの研究では、ヒトの骨、歯、毛、または凍った土壌、氷、または寒い洞窟で典型的に保存されている他の組織から採取した非常に純粋なDNAサンプルを使用したことが判明しました。より頻繁に、科学者によって発見された人間の遺体は、人間のDNAを遺伝子で湿らせて分析するには高価すぎるように、細菌を抱くほど暖かい土壌に座っています。先週、米国遺伝学会(American Human Genetics Society)の年次総会で発表された、古代のヒトDNAサンプルを精製する賢明な新しい方法が、それを変える可能性があります。

ヒトの歯または骨から採取された平均の古代DNAサンプルは、しばしば1%未満の短く分解されたヒトDNA断片である。残りは細菌DNAである。科学者はこのジェミシックを配列することができましたが、ヒトDNA部分を拡大するためにシークエンシング装置を何度も使用しなければならず、コストがかかりません。その代わりに、研究者は、しばしば、関心のある遺伝子または配列とおおよそ一致する近代的なヒトDNAのストレッチを準備し、これらのいわゆるプローブを用いてサンプルをろ過する。 (現代と古代のヒトDNAはプローブが古代のDNAに固執するほど類似している)しかし、これは依然として高価であり、ゲノムのサブセットの配列しか明らかにしていない。

スタンフォード大学のチームは今、より良いアイデアを考え出しています。博士研究員のメレディス・カーペンター氏とカルロス・ブスタマンテの研究室の他の研究者は、DNAの代わりにRNAからプローブを作りました。これは「非常に安い」とBustamanteは言います。彼らは、平均的な近代的ヒトの全ゲノムをカバーするのに十分なRNAプローブを作る方法を見出した。プローブには特殊なビーズに付着する化学基があるため、研究者がプローブを古代のDNAサンプルと混合すると、非ヒトDNAを洗い流すことができます。最後のステップは、RNA咀嚼酵素を使用してプローブを除去し、純粋な古代ヒトDNAのみを残し、それからゲノム配列決定機に供給することである。

研究者らは、500〜3500歳の古代の骨、歯、および髪のDNAサンプルを数十種類のこのフィルター法で試験したところ、サンプルから2〜13倍多くのヒト遺伝子配列を採取しました。同じ回数。この高分解能により、サンプルに関する新しい情報が得られました。例えば、以前はブルガリアの2500年以上のブロンズ・エイジの歯がヨーロッパ人であったとしか言えないが、彼らは現在、その民族の起源を中部または南部ヨーロッパに絞り込むことができた。チームはまた、スペインの探検家が主張したように、500歳以上のペルーのミイラにはヨーロッパの祖先がいないと判断することもできました。

この新しい方法は、「全ゲノム配列決定に従う試料の数を大幅に増やす」と同会議の講演でBustamanteは述べた。 (この研究でも その日にオンラインで登場した ザ アメリカン・ジャーナル・オブ・ヒューマン・ジェネティクス )彼と彼の同僚は現在、犬の家畜化を解明するために古代の犬のDNAでそれを試みている。彼らはまた、汚染されたヒトDNAサンプルを扱う現代の法医学者だけでなく、サンプルから汚染されたヒトDNAを除去する必要がある微生物ゲノミクス研究者にとって、このアプローチが役立つかもしれないと考えている。

この方法は、「スーパーエキサイティングで非常に面白い」と、会議でNeandertalゲノムを研究するハーバード大学の遺伝学者David Reichは述べた。彼は言う 科学 電子メールでは、配列決定に十分なDNAを持ったネアンデルタールのサンプルがあるが、それはバクテリアによっても汚染されているので価値がない。 「この難しいが重要な古代のDNAサンプルの全ゲノムシーケンシングのためのアプローチが実用的な方法になるかどうかはまだ分かっていると思うが、これも考えられるのはエキサイティングだ」

Loading ..

Recent Posts

Loading ..